일신기독병원은 호주 장로교 한국선교회에 의하여,
종교적 가치에 따라 그리스도의 봉사와 박애 정신을
구현하기 위한 진료 사업을 펼치기 위하여 설립되었다.

1952년 부산에서 오스트레일리아 장로교 한국선교회에 의하여 일신부인병원으로 개원하였다. 산부인과 진료와 함께 조산간호원 및 여의사에 대한 전문교육을 병행함으로써 당시 부족하였던 모자보건 분야의 전문요원 양성에 주력하였다. 1982년 현재의 명칭으로 변경하였고, 1988년 6월 23일 부산 경남 모자 보건 센터를 개소하였다.
1994년 8월 29일 고(故) 장기려(張起呂)[1911~1995] 박사가 세운 청십자병원을 인수하여 수정동에 일신청십자병원을 개원[1996년 폐업]하였다. 1999년 1월 16일 화명동에 화명일신기독병원을 개원하였고, 2008년 4월 17일 호주 선교사였던 맥켄지의 이름을 딴 맥켄지 전문 진료 센터를 개원하여 현재 재활 전문 병원으로 운영되고 있으며, 2018년 4월 26일 정관일신기독병원을 개원하여 오늘에 이르고 있다.